羅氏 NimbleGen 新推出細(xì)胞遺傳學(xué)芯片 CGH ISCA Plus)

羅氏NimbleGen新推出針對(duì)細(xì)胞遺傳學(xué)的NimbleGen CGH ISCA Plus細(xì)胞遺傳學(xué)芯片。細(xì)胞遺傳學(xué)研究在發(fā)育異常及腫瘤研究中都占有重要地位，其主要研究?jī)?nèi)容為染色體異?，F(xiàn)象，包括拷貝數(shù)改變(Copy Number Variation, CNV)以及雜合性丟失(Loss of Heterozygosity, LOH)。這款新產(chǎn)品擁有420萬個(gè)DNA探針，包含有檢測(cè)CNV的CGH探針以及檢測(cè)LOH的SNP探針，可同時(shí)亦高分辨率地檢測(cè)CNV及LOH。不需要任何實(shí)驗(yàn)流程的改變，就可以完成同時(shí)兩種測(cè)試。

該款芯片包含了來自ISCA, OMIM, Decipher等多個(gè)遺傳性**數(shù)據(jù)庫，廣泛的細(xì)胞遺傳學(xué)研究?jī)?nèi)容。

針對(duì)418種的**相關(guān)區(qū)域進(jìn)行設(shè)計(jì)，包括ISCA, OMIM, Decipher數(shù)據(jù)庫的4200種基因：

■ 含有約50萬個(gè)CGH探針，CNV分辨率可達(dá)15-20Kb

■ 通過64000個(gè)snp探針檢測(cè)LOH，分辨率達(dá)到5Mb

■ 一張芯片可檢測(cè)多個(gè)樣本，降低實(shí)驗(yàn)成本

在數(shù)據(jù)分析方面，該產(chǎn)品配有不同的設(shè)計(jì)文件，可以以不同CNV及LOH分辨率解讀芯片實(shí)驗(yàn)結(jié)果，并參照ISCA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行分析，如ISCA 44k，ISCA 60K，ISCA 105K，ISCA 180K，可以根據(jù)研究需要進(jìn)行選擇。芯片可使用Deva、Nexus Copy Number Analysis 軟件進(jìn)行分析，按照不同設(shè)計(jì)文件進(jìn)行數(shù)據(jù)儲(chǔ)存及處理，獲得圖形化的CNV、LOH分析結(jié)果，并可與Decipher, 、ISCA 等數(shù)據(jù)庫相連，生成細(xì)胞遺傳學(xué)報(bào)告。

該芯片實(shí)驗(yàn)的優(yōu)勢(shì)在于快速、高分辨率地檢測(cè)全基因組水平的染色體異常情況。相比傳統(tǒng)的染色體分型、原位雜交方法，更加高效，同時(shí)還可為每個(gè)樣本選取合適的對(duì)照，如腫瘤組織樣本與正常組織樣本進(jìn)行對(duì)比，出生缺陷兒童的樣本與其正常父母樣本進(jìn)行直接比較。